【解析】主要是结合19世纪中期的两部国际法，从主权的独立和不可分割两个方面，完整地运用主权理论的原则进行分析。

（2）答案1：能完整地运用主权理论的原则进行分析。
格劳秀斯的《战争与和平法》提出国家主权“对内最高，对外独立”的原则，主权国家是国际法的主体，第二次鸦片战争违反了国际法的这些原则，所以是侵略战争。
《威斯特伐利亚和约》确立了国家主权平等，国家主权的统一性、不可分割性和独立性等原则，第二次鸦片战争违反了国际法的这些原则，所以是侵略战争。
答案2：未能完整地运用主权理论的原则进行分析。
答案3：仅有正确结论。
第二次鸦片战争是侵略战争。