参公事业单位顾名思义就是指参照公务员管理的事业单位，单位属于事业性质，但执行公务员法，按照公务员模式套发工资、执行晋升。事业单位是大概念，包括公益类事业单位、生产经营类事业单位和参公事业单位，参公事业只是其中一种类型。
1、身份区别。参公事业单位和其它普通事业单位都使用事业编制，但参公事业人员进行过参公登记，不执行事业单位管理条例，而是按照公务员法管理，在工资待遇和晋升方式上等同于公务员，可以在参公单位和行政机关自由流动(部分地区仍有障碍)，身份待遇明显“高”于普通事业编制人员。由于是公务员身份属性，进入参公事业单位需要参加公务员国考或省考，而普通事业单位则只需参加所在地区的事业单位招考。
2、待遇区别。参公身份等同于公务员，执行公务员工资标准，享受车补和年终绩效奖等待遇，而普通事业编制人员绝大多数地区没有车补，在年终绩效这一块普遍也比公务员要低，加上一些津补贴上的差距，参公事业人员年均收入保守要比普通事业编制人员多出两万以上。对靠拿死工资的上班族来说，这是不小的差距。
3、改革区别。参公事业单位主要集中在行政类事业单位和执法类事业机构。其中，行政类事业单位在本轮党政机构改革中已经全部清理，并入行政机关作为内设机构，或者剥离行政职能改为公益类事业单位，今后不再增设或单设行政类事业单位，不再允许事业单位出现委、办、局字样。执法类事业机构暂时不列入改革范畴，维持现状，有待中央进一步明确政策统一部署改革。其它事业单位按照事业单位分类改革要求，将在2020年底前全部完成改革。其中，公益一类事业单位基本保持现状，部分职能相近的或撤并整合，减少机构形成合力;公益二类事业单位改革分三种类型，效益差点、主要职责是公益服务的，剥离收费或经营职责，改为公益一类;效益一般、可以维持单位正常运转的，保持现状;效益好的、主要职责是收费或经营职责的，剥离公益职责，改为企业。生产经营类事业单位主要是自收自支性质，这类单位非常明确，在2020年底前全部改企，人员除极少部分根据职能改革，划转到其它事业单位安置外，其余的全部随单位改革全部转为聘用制人员。
