由实验结果可知，三种微生物的淀粉酶的活性大小关系为：

第一步，本题考查物理知识。
第二步，淀粉在淀粉酶的作用下，能水解成还原性糖，所以生成的还原性糖越多，说明淀粉的剩余量越小，因此可用斐林试剂来检测生成物的量。根据实验结果可知：用碘液检验淀粉的剩余量时，颜色深浅程度最浅的是试管2，说明试管2中的淀粉最少，产生的还原性糖最多，因此颜色变化最深。三种酶的活性大小的关系为乙>丙>甲，淀粉酶的化学本质是蛋白质，是由基因决定的。
因此，选择B选项。